По способам управления СКУД делятся на две группы: автономные и сетевые.
Автономные системы не предполагают подключения к централизованным системам управления. Это отдельные блоки, сравнительно недорогие и с простой установкой. Для них не требуется прокладка кабелей, а стоимость эксплуатации минимальна. Однако такие системы не накапливают информацию, из-за чего их функционал ограничен: нет учета рабочего времени персонала и выдачи отчетности по посещениям за определенный период.
Кроме того, отсутствие централизации не позволяет оперативно проводить смену кодов безопасности в случаях, когда на объекте используется много точек доступа, различных уровней секретности.
Сетевые системы управляются централизованным компьютером. Это позволяет оперативно изменять коды доступа для всей системы или отдельных ее элементов. Кроме того, СКУД обеспечивает учет и хранение информации с предоставлением отчетности. Подобные системы организуют учет рабочего времени персонала.
Сетевые системы оптимальны для крупных предприятий с многочисленными точками доступа различной степени секретности на большой территории. Кроме того, подобные системы включаются в комплексные системы безопасности, объединенные с видеонаблюдением, пожарной и охранной сигнализацией. Это позволяет получить наивысшую степень защиты объекта.